외톨이 소녀 릴로에게 인생은 커다란 도전이다. 어린 소녀 릴로는 열아홉 살 된 언니 나나와 함께 하와이 섬에서 단 둘이 산다. 

언니와 싸우는 날이 더 많지만 릴로는 사회복지사에 이끌려 입양되는 것보다 언니와 함께 살게 해 달라고 하늘에서 떨어지는 별똥별을 바라보며 하느님한테 소원을 빈다.

 

릴로가 보았던 별똥별은 실은 스티치가 타고 있던 우주선이었다. 실험용 외계 생명체 626호로 불리우는 스티치는 투로 행성 출신. 사고뭉치에다가 말썽꾸러기인 스티치는 교도소로 끌려가다가 도망을 쳤는데 그만 지구에 떨어진 스티치는 트럭에 깔려서 정신을 잃는다.

 

그가 깨어난 곳은 동물 보호소! 그곳에서 스티치는 애완동물을 입양하러 온 릴로를 만나고 스티치라는 이름까지 얻게 된다.

거대한 우주선을 타고 나타난 총사령관 간투대장이 스티치를 잡아 우주로 끌고가는 과정에서 스티치는 간신히 탈출에 성공하지만 릴로는 포로가 되어 끌려간다. 

자신이 릴로와 나니에게 가족이나 다름없었다는 것을 깨달은 스티치는 줌바와 플리클리에게 릴로를 구하러 가자고 설득한다. 

스티치의 활약 덕분에 납치되어가던 릴로가 구출되고 총사령관이 부하들을 이끌고 지구에 직접 찾아오게 되는데...

 

과연 총 사령관은 스티치를 체포할 수 있을 것인지.